故事发生在21世纪的凤天市，讲述主人公安小武、元飞飞、白羽、周豪、金昊、陈默等人的战卡机因意外导入R程式程序而被激活，由此开始了风靡全国的关卡战馆比赛。在越来越激烈的战馆通关过程中，反派BOSS黑

基因石能量渐渐恢复成基因石，且显露出更强大的力量、更多不为人知的秘密。反派势必不会轻易罢休，将以更强大的姿态卷土重来。但在艰难的挑战中，普力士等人仍看到了希望：宇宙中，分散著为数不明的「变形联盟战士」

变形联盟和海澄合力击败敌人，平溪市再次回归和平。然而时空能量异常波动情况却愈演愈烈，导致现实世界与平行宇宙发生交错产生了时空歧点，时空兽也随之出现。就在变形联盟忙于对付时空兽修复时空歧点时，茜卡与双子